С каждым апдейтом macOS Apple все больше завинчивают гайки для любителей пиратских и сторонних приложений. Правда завинчивают не особо рьяно - пункты из меню пропадают, но в системе еще есть лазейки, чтобы их вернуть.
Например, сегодня я столкнулся с тем, что из настроек системы (Настройки -> Защита и безопасность) пропал пункт "Из всех источников", в подменю "Разрешить использование программ, загруженных из":

snimok-ekrana-2016-09-25-v-16-48-53

К счастью, это исправляется в два клика - запускаем терминал (Cmd+Enter -> вводим terminal -> Enter).
И вставляем такую команду:

sudo spctl --master-disable

После этого необходимо ввести пароль пользователя, и в меню появляется нужный нам пункт:

snimok-ekrana-2016-09-25-v-16-54-21

Могу предположить, что вы не сможете установить некоторые старые/неподписанные/опасные приложения без этого действия - отключения Gatekeeper.
После того, как проведете нужные вам действия, можно включить защиту от неподписанных приложений обратно, командой

sudo spctl --master-enable

Можно похвалить Apple за то, что они таким образом заботятся о безопасности пользователей, но меня все же не покидает ощущение того, что это все делается не сколько ради безопасности, сколько ради борьбы с пиратством и продвижения App Store (который потихоньку умирает). Подробнее о том, почему разработчики приложений для macOS предпочитаю продавать программы через собственные сайты, можно почитать здесь.
Возможно, в следующем большом релизе мы вообще лишимся возможности устанавливать неподписанные программы, кто знает.